MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Dactylococcopsis salina PCC 8305 chromosome

Total Repeats: 15517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019780	AGA	2	6	2350	2355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019780	ATC	2	6	2357	2362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019780	ATC	2	6	2402	2407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019780	C	6	6	2407	2412	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_019780	ATC	2	6	2446	2451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019780	TC	3	6	2541	2546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019780	CTT	2	6	2548	2553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019780	C	6	6	4195	4200	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_019780	CCT	2	6	4204	4209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_019780	TAA	2	6	4219	4224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019780	TTA	2	6	6442	6447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019780	TAT	2	6	6448	6453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019780	TAA	2	6	6523	6528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019780	CATAAA	2	12	6534	6545	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019780	ATA	2	6	6554	6559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019780	ATT	2	6	6568	6573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019780	GA	3	6	6583	6588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019780	TAA	2	6	6617	6622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019780	C	6	6	7056	7061	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_019780	TAA	2	6	7100	7105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019780	ATT	2	6	7197	7202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019780	A	6	6	7207	7212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019780	TAC	2	6	10176	10181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019780	A	6	6	10185	10190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019780	TCC	2	6	10200	10205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_019780	GA	3	6	10231	10236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019780	TTC	2	6	10243	10248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019780	TAC	2	6	10659	10664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019780	ACCCT	2	10	10695	10704	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_019780	AAT	2	6	11590	11595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019780	TAAT	2	8	11675	11682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019780	CATTT	2	10	12861	12870	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019780	GCGAA	2	10	13012	13021	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019780	ATTT	2	8	13071	13078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019780	ATC	2	6	13079	13084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019780	ATC	2	6	14383	14388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019780	AATT	2	8	15181	15188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019780	TCT	2	6	15209	15214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019780	GA	3	6	17294	17299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019780	GA	3	6	17334	17339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019780	A	6	6	17409	17414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019780	TCA	2	6	17482	17487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019780	A	9	9	17493	17501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019780	GCCT	2	8	17514	17521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019780	TTTA	2	8	18552	18559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019780	ATT	2	6	18574	18579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019780	GAT	2	6	18591	18596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019780	TAG	2	6	19291	19296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019780	AATCT	2	10	19381	19390	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_019780	AAG	2	6	19402	19407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019780	TCGA	2	8	19465	19472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019780	GGTT	2	8	19513	19520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019780	TCAA	2	8	20135	20142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019780	AGAC	2	8	20261	20268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019780	AGA	2	6	20269	20274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019780	A	6	6	20274	20279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019780	CTT	2	6	20280	20285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019780	AAAAT	2	10	20343	20352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019780	CAA	3	9	21949	21957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019780	ACA	2	6	21959	21964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019780	AT	3	6	21965	21970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019780	GA	3	6	21971	21976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019780	ATT	2	6	22048	22053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019780	GCT	2	6	22128	22133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019780	CGC	2	6	22142	22147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_019780	CAG	2	6	22180	22185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019780	CAT	2	6	22262	22267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019780	CA	3	6	22282	22287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019780	ATT	2	6	22298	22303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019780	T	6	6	22354	22359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019780	ATA	2	6	22460	22465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019780	TGAT	2	8	22542	22549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019780	TGAT	2	8	22584	22591	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019780	TGA	2	6	23536	23541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019780	TAGGA	2	10	23576	23585	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019780	ACA	2	6	23596	23601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019780	GA	4	8	23607	23614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019780	T	7	7	24625	24631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019780	T	6	6	24663	24668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019780	AGA	2	6	24676	24681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019780	CAA	2	6	25384	25389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019780	GAAAC	2	10	25415	25424	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019780	GAAA	2	8	25571	25578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019780	TTA	2	6	25599	25604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019780	T	6	6	25618	25623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019780	ACC	2	6	25693	25698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_019780	CGA	2	6	25718	25723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019780	TTA	3	9	25756	25764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019780	GAA	2	6	27496	27501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019780	GGTTG	2	10	29144	29153	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019780	C	6	6	29158	29163	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_019780	C	6	6	29166	29171	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_019780	G	6	6	29178	29183	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019780	AAG	2	6	29186	29191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019780	GGTTG	2	10	29220	29229	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019780	C	6	6	29234	29239	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_019780	C	6	6	29242	29247	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_019780	G	6	6	29254	29259	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019780	AAG	2	6	29262	29267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019780	GGTTG	2	10	29296	29305	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019780	C	6	6	29310	29315	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_019780	G	6	6	29330	29335	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019780	AAG	2	6	29338	29343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019780	C	6	6	29391	29396	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_019780	G	6	6	29426	29431	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019780	AGT	2	6	29437	29442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019780	TCTAT	2	10	29476	29485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019780	GGTTG	2	10	29492	29501	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019780	C	6	6	29506	29511	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_019780	C	6	6	29514	29519	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_019780	G	6	6	29526	29531	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019780	AAG	2	6	29534	29539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019780	ATC	2	6	29577	29582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019780	C	6	6	29582	29587	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_019780	G	6	6	29617	29622	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019780	GGTTG	2	10	29635	29644	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019780	C	6	6	29649	29654	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_019780	C	6	6	29657	29662	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_019780	G	6	6	29669	29674	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019780	AAG	2	6	29677	29682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019780	C	6	6	29730	29735	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_019780	G	6	6	29752	29757	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019780	G	6	6	29781	29786	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019780	ATCG	3	12	33102	33113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019780	ATGA	2	8	33266	33273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019780	AAG	2	6	33359	33364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019780	GTTTC	2	10	33499	33508	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_019780	TC	3	6	33507	33512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019780	TCT	2	6	34297	34302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019780	TAA	2	6	35720	35725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019780	CAA	2	6	36273	36278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019780	ACT	2	6	37292	37297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019780	TAA	2	6	37344	37349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019780	CGT	2	6	37352	37357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019780	T	6	6	37818	37823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019780	GAC	2	6	37827	37832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019780	AG	3	6	37891	37896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019780	TAA	3	9	37907	37915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019780	A	6	6	38019	38024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019780	CAG	3	9	38042	38050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019780	TAG	2	6	38144	38149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019780	CGA	2	6	38194	38199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019780	ATC	2	6	38201	38206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_019780	TCT	2	6	38213	38218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019780	TCGA	2	8	38477	38484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019780	GA	3	6	40206	40211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019780	T	6	6	42212	42217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019780	A	6	6	42221	42226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019780	TTA	2	6	42263	42268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_019780	CAA	2	6	43766	43771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_019780	GGA	2	6	43784	43789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019780	GGA	2	6	43983	43988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019780	GTT	2	6	44047	44052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_019780	A	6	6	46396	46401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_019780	G	6	6	119060	119065	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
441	NC_019780	C	6	6	119162	119167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
442	NC_019780	G	6	6	119198	119203	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_019780	CCACC	2	10	119484	119493	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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461	NC_019780	AATC	2	8	121608	121615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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463	NC_019780	A	6	6	122724	122729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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